PLoS Genet：轮回肿瘤DNA片断更短小 有助开发液体活检新技能

2016年7月20日讯 /生物谷BIOON/ --按照一项揭晓于国际学术期刊Plos Genetics上的最新研究，轮回肿瘤DNA与一般游离DNA于长度上存于不同，据此或者可哄骗病人血液帮忙开发检测肿瘤DNA的液体活检新技能。

作者： 年夜康健派编纂来历： 中国IDC圈2016-07-21 09:25:36

2016年7月20日讯 /生物谷BIOON/ --按照一项揭晓于国际学术期刊Plos Genetics上的最新研究，轮回肿瘤DNA与一般游离DNA于长度上存于不同，据此或者可哄骗病人血液帮忙开发检测肿瘤DNA的液体活检新技能。

液体活检技能可以从血液中发明以及诊断癌症，还可以帮忙监测癌症复发，评估医治效果，可是这项技能仍旧存于监测敏捷度的问题，年夜年夜限定了该技能的成长。美国犹他年夜学以及华盛顿年夜学的研究职员发明，比拟在一般细胞的DNA片断，来历在肿瘤细胞的轮回DNA长度更短。

文章作者Hunter Underhill暗示： 按照差别来历的轮回DNA片断长度差别，可以检测到实体瘤的存于。

研究职员于多形性成胶质细胞瘤小鼠模子中发明了上述征象。于研究中他们将人的多形性成胶质细胞瘤干细胞样系导入小鼠脑部，随后于血液中检测到了人类ctDNA，他们对于比了人类肿瘤来历ctDNA以及小鼠一般游离DNA的不同，发明人类ctDNA的长度通常是134个碱基，而小鼠一般游离DNA长度通常是167个碱基。研究职员还将人类肝细胞癌细胞植入小鼠体内也发明了近似征象，这注解轮回肿瘤DNA长度更短是相对于遍及的征象。

随后研究职员还对于玄色素瘤患者以及康健人体内的游离DNA举行了对于比，他们发明玄色素瘤患者的游离DNA片断遍及更短。他们还对于比了肺癌患者以及康健人的游离DNA，成果注解肺癌患者来历的游离DNA长度也更短小。

研究职员对于比了来自在EGFR T790M突变肺癌患者以及康健人轮回DNA测叙文库，成果发明当DNA片断比平均长度短20到50个碱基时，该片断等位基因的突变率晋升2.5到9.1倍。这申明短的游离DNA可提醒更高的等位基因突变率。

作者暗示，对于短的游离DNA举行正确筛查将有助在等位基因突变及肿瘤的发明，但此中的机制还需要更多研究举行进一步展现。（生物谷Bioon.com）

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Doi:http://dx.doi.org/10.1371/journal.pgen.1006162

Fragment Length of Circulating Tumor DNA

Hunter R. Underhill,Jacob O. Kitzman,Sabine Hellwig,Noah C. Welker,Riza Daza,Daniel N. Baker,Ke�����APPith M. Gligorich,Robert C. Rostomily,Mary P. Bronner,Jay Shendure

Malignant tumors shed DNA into the circulation. The transient half-life of circulating tumor DNA (ctDNA) may afford the opportunity to diagnose, monitor recurrence, and evaluate response to therapy solely through a non-invasive blood draw. However, detecting ctDNA against the normally occurring background of cell-free DNA derived from healthy cells has proven challenging, particularly in non-metastatic solid tumors. In this study, distinct differences in fragment length size between ctDNAs and normal cell-free DNA are defined. Human ctDNA in rat plasma derived from human glioblastoma multiforme stem-like cells in the rat brain and human hepatocellular carcinoma in the rat flank were found to have a shorter principal fragment length than the background rat cell-free DNA (134 144 bp vs. 167 bp, respectively). Subsequently, a similar shift in the fragment length of ctDNA in humans with melanoma and lung cancer was identified compared to healthy controls. Comparison of fragment lengths from cell-free DNA between a melanoma patient and healthy controls found that theBRAFV600E mutant allele occurred more co妹妹only at a shorter fragment length than the fragment length of the wild-type allele (132 145 bp vs. 165 bp, respectively). Moreover, size-selecting for shorter cell-free DNA fragment lengths substantially increased theEGFRT790M mutant allele frequency in human lung cancer. These findings provide compelling evidence that experimental or bioinformatic isolation of a specific subset of fragment lengths from cell-free DNA may improve detection of ctDNA.

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