google推进于线医疗 推人类基因组云端办事工程

“有时辰科学家们会想要做一些比力疯狂的工作，那末就需要必然的数据存储以及阐发处置惩罚威力，”达塔说道，“而google今朝就可以提供这类威力，以是我以为这是一种准确的技能成长标的目的，也是值患上整个科研界为之必定以及鼓动勉励的。”

作者： 年夜康健派编纂来历： 中国IDC圈2016-07-19 10:32:25

据外洋媒体的报导，google近来正于经由过程一个名为 Google Genomics 的工程与病院以及年夜学试验室睁开互助，配合推进人类基因组的存储、对于比以及阐发事情。

Google Genomics 是google于去年 3 月推出的一项云端办事，但随后因为没有举行年夜范围的推广而并未惹起人们的留意，该工程皆于帮忙年夜学试验室以及病院将患者或者科研对于象的生物基因贮存到云端上，办事的方针是 切磋遗传变异交互 ，象征着科研专家可以或许拜候数百万的生物基因组数据，并能轻松简朴的举行对于比以及阐发。除了了google以外，人类基因组数据的存储今朝还已经经惹起了亚马逊、IBM 以及微软等科技巨头的留意。

google自 Google Genomics 工程启动以来，已经经与多位科学家举行了面谈并专门为此开放了一个 API 接口，利便这些科学家将 DNA 数据转移到google的办事器群上，而科学家则可使用这个席卷了数十亿互联网用户以及网页索引的数据库举行试验。

生物学家们可以经由过程咱们的办事来从对于一个基因组的研究进级到对于数百万个基因组举行研究， 主管 Google Genomics 工程研发的软件项目师年夜卫 格雷泽（David Glazer）说道， 咱们但愿经由过程咱们的数据技能来帮忙他们实现质的冲破。

只管有些科学家以为google的办事对于在繁杂的基因组数据来讲不外是人浮于事，但照旧有不少科学家对于此举行了必定，好比斯坦福年夜学的传授阿图尔 巴特（Atul Butte）于本年对于google的这一规划举行具体相识以后，就暗示 这觉得就像是传统旅行社于看到 Expedia（全世界最年夜的于线游览公司）同样 。

科学家们今朝于使用新型装备于对于 DNA 举行解码时所得到的数据愈来愈多，速率也愈来愈快，如剑桥伯德研究所（Broad Institute in Cambridge）的有关卖力人就先容称，于本年 10 月的试验中，他们每一解码一小我私家类基因组需要 32 分钟，所孕育发生的原始数据高达 200TB。

虽然这类量级的数据流与年夜型互联网公司所处置惩罚的数据相去甚远（伯德研究所两个月所孕育发生的数据与 YouTube 上一天的数据上传量相仿），但却远远跨越了任何一名生物学家的处置惩罚威力。就今朝环境而言，此类数据的存储以及拜候凡是经由过程年夜型的贸易数据中央来实现。美国国度癌症研究地点上月曾经暗示将耗资 1900 万美元将巨细为 2.6PB 的癌症基因组图谱数据的正本存储到云端，这些触及数千名癌症患者的数据的正本将来也将会存储到google Google Genomics 工程以及亚马逊的数据中央。

西雅图体系生物学研究所（Institute for Systems Biology）的科学家希拉 雷诺兹（Sheila Reynolds）指出，他们但愿创立一个 癌症基因组数据云 ，让科学家们可以像使用传统收集搜刮那样简洁地分享信息以及举行虚拟试验， 究竟其实不是每一个人都拥有处置惩罚 PB 级数据的威力的， 她说道。

google以及亚马逊已经经就 DNA 数据向云端转移的用度举行了为期一年的价格战。google暗示每一个基因组的年存储费为 25 美元，而计较这些数据还需要付出分外的用度。今朝一小我私家类基因组于解码以后的原始数据巨细于 100GB 摆布，不外该数据还可以被精简至 1GB 如下，google对于此类数据的云端贮存价为每一年 0.25 美元。

云存储办事于必然水平上鞭策了 Tute Genomics、Seven Bridges 以及 NextCode Health 等草创企业的成长，这些公司均致力在研究可以或许帮忙病院以及科学家检索基因数据的 阅读器 办事。 google以及亚马逊所提供的是后端办事，他们每每会鼓动勉励咱们于他们的云端创立基因组公司， Seven Bridges 的首席履行官德尼兹 库鲁尔（Deniz Kural）先容道，该公司今朝于亚马逊的云端存储并治理着 1600 位研究职员所提供的基因组数据。

库鲁尔指出，将来一款药物的研究以及运用也将会依靠在于全世界 DNA 互联网 长进行数据检索， 按照咱们的猜测，插手我于将来身患肺癌，那末大夫就会对于我的基因组以及肿瘤基因组举行测序，然后将对于应的数据与数据库中的 5000 万组数据举行对于比， 他说道， 成果就是可以或许于短期内找到最合适我的药物。

按照google软件项目师格雷泽的先容，Google Genomics 工程旨于鞭策生物医学研究从 作坊式 向 工业化范围出产 成长，今朝他本人也于进修遗传基因方面的常识，同时也于听伯德研究所总监埃里克 兰德尔（Eric Lander）的《生物学概述》（Introduction to Biology）课程，此外格雷泽也已经经将本身的基因组测序数据放于了google的云端。

格雷泽并�����APP未谈及 Google Genomics 工程的范围和今朝为几多客户提供办事，只是吐露称今朝已经经有 3500 组来自大众工程的基因组存储于google的办事器上。同时他还指出该工程与google于近期鼎力大举投入的保健类工程（如google于本年启动的研究怎样延伸人类寿命的 Calico 工程）暂无联系关系， 与基因组有关的就是人们正于逐渐熟悉到科学技能是可以或许鞭策并转变生命科学研究的近况的， 格雷泽说道。

卖力治理斯坦福年夜学内最年夜的遗传数据计较机集群的物理学家索马里 达塔（Somalee Datta）暗示，因为google以及亚马逊的云存储办事于近期都下调了价格，其存储成本已经经降至与他们的数据中央运营成真相似的程度， 咱们以为云存储价格照旧继承降落，始终到比力合理的区间， 达塔说道。

达塔还先容说，今朝一些斯坦福的科学家已经经最先使用google的 BigQuery 数据库体系（格雷泽的团队已经经将该体系与基因组数据相兼容），该体系最初是为了跟踪网平易近勾当而开发的，但其一样可以或许帮忙科学家们举行数以千计的年夜型基因组实验。

有时辰科学家们会想要做一些比力疯狂的工作，那末就需要必然的数据存储以及阐发处置惩罚威力， 达塔说道， 而google今朝就可以提供这类威力，以是我以为这是一种准确的技能成长标的目的，也是值患上整个科研界为之必定以及鼓动勉励的。

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